(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210281910.6 (22)申请日 2022.03.22 (71)申请人 中国科学院北京基因 组研究所 （国 家生物信息中心） 地址 100101 北京市朝阳区北辰西路1号院 104号楼 (72)发明人 康禹　楚亚男　邵长君　王建　 陈婧　 (74)专利代理 机构 北京集佳知识产权代理有限 公司 11227 专利代理师 王欢 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12Q 1/689(2018.01) C12Q 1/6888(2018.01)G01N 33/68(2006.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/46(2006.01) C12R 1/92(2006.01) (54)发明名称 标志物及其检测试剂在制备筛查和/或辅助 诊断ASD的试剂盒中的应用 (57)摘要 本发明提供了标志物及其检测试剂在制备 筛查和/或辅助诊断ASD的试剂盒中的应用。 本发 明研究发现口腔链球菌Streptococcaceae(科) 丰 度 、 口 腔 链 球 菌 噬 菌 体 (Streptococcalphages)丰度以及所携带的毒力 因子(virulence  factors， VFs)丰度， 在ASD与正 常儿童口腔中有显著 差异， 且与ADOS评分和语言 交流评分等临床表现的严重程度密切相关， 在平 行的肠道菌群取样中未观察到这些变化， 这表明 ASD发病机制与链 球菌噬菌体过度富集之间存在 一种前所未有的口腔特异性关联， 并且与疾病严 重程度密切相关。 权利要求书1页 说明书5页 附图3页 CN 114807342 A 2022.07.29 CN 114807342 A 1.标志物在制备筛查和/辅助诊断孤独症的试剂 盒中的应用， 其特征在于， 所述标志物 包括口腔链球菌、 链球菌噬菌体、 链球菌毒力因子中的至少一种。 2.检测标志物的试剂制备筛查和/辅助诊断孤独症的试剂 盒中的应用， 其特征在于， 所 述标志物包括口腔链球菌、 链球菌噬菌体和链球菌毒力因子中的至少一种。 3.根据权利要求1或2所述的应用， 其特征在于， 所述链球菌毒力因子包括virulence   factor database 数据库中所有可检出的至少一种链球菌毒力因子 。 4.筛查和/辅助诊断孤独症的试剂盒， 其特征在于， 包括检测标志物的试剂； 所述所述 标志物包括口腔链球菌、 链球菌噬菌体、 链球菌毒力因子中的至少一种。 5.根据权利要求4所述的试剂盒， 其特征在于， 所述链球菌毒力因子包括包括 virulence  factor database 数据库中所有可检出的至少一种链球菌毒力因子 。 6.根据权利要求4所述的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂包括检测所述标志物的引物、 探针和/或抗体。 7.根据权利要求4所述的试剂盒， 其特征在于， 还包括DNA提取试剂盒， 蛋白提取试剂 盒， PCR扩增试剂盒中的至少一种。 8.根据权利要求7所述的试剂盒， 其特征在于， 还包括用于基因测序和/或免疫检测的 其他试剂。 9.一种辅助治疗孤独症的产品， 其特征在于， 所述产品能够降口腔链球菌、 链球菌噬菌 体和链球菌毒力因子中的一种或多种的丰度和/或含量。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114807342 A 2标志物及其检测试剂在制备筛查和/或辅助诊断ASD的试剂盒 中的应用 技术领域 [0001]本发明涉及医学技术领域， 尤其涉及标志物及其检测试剂在制备筛查和/  或辅助 诊断ASD的试剂盒中的应用。 背景技术 [0002]孤独症是一种复杂的神经系统发育疾病， 出现在生命的最初几年， 可能导致终生 残疾。 近年来ASD的发病率显着增加， 但由于ASD的病因和发病机制尚未完全了解， 目前缺乏 有效的生理诊断及医疗干预措施。 传统的ASD诊断仅通过行为量表进行(CARS、 DSM ‑5、 ABC、 ADI‑R、 ADOS 等)， 该方法基于观察和问卷评分综合判定， 与生理学改变相比， 比较滞后。 虽 然目前已出现基于血液尿液代谢物、 生物酶以及肠道菌群的诊断标志物， 但因这些因素与 疾病的关系复杂， 上述诊断标志 物， 准确率和灵敏度无法满足临床应用。 [0003]ASD的主要病理生理特征之一是神经系统和肠道粘膜的慢性炎症， 越来越多的证 据表明人类肠道 微生物群与 ASD的发展有关。 然而， 现有  ASD菌群特征多由普通的宏基因组 丰度差异分析获得， 与病情严重程度相关性不大， 不能建立清晰的发病机制， 准确性较低， 存在大量 假阳性和假阴性。 发明内容 [0004]鉴于此， 本发明提供了标志物及其检测试剂在制备筛查和/或辅助诊 断 ASD的试 剂盒中的应用， 所述标志物所述标志物包括口腔链球菌、 链球菌噬菌体、 链球菌毒力因子中 的至少一种。 本发明 以口腔链球菌及口腔链球菌噬菌体和/或链球菌毒力因子为标志物可 准确进行AS D的诊断和患病风险评估， 并可作为AS D生物治疗的靶点。 [0005]为了实现上述发明目的， 本发明提供以下技 术方案： [0006]标志物在制备筛查和/辅助诊断孤独症的试剂盒中的应用， 所述标志物包括口腔 链球菌、 链球菌噬菌体、 链球菌毒力因子中的至少一种。 [0007]本发明中， 所述链球菌毒力因子包括virulence  factor database(VFDB)  数据库 中所有可检出的链球菌毒力因子 。 [0008]本发明还提供了检测标志物的试剂制备筛查和/辅助诊断孤独症的试剂盒中的应 用， 所述标志 物包括口腔链球菌、 链球菌噬菌体和链球菌毒力因子中的至少一种。 [0009]在本发明的上述应用中， 所述标志物包括口腔链球菌、 链球菌噬菌体和链球菌毒 力因子中的至少两种。 优选地， 所述标志物包括口腔链球菌、 链球菌噬菌体和链球菌毒力因 子中的至少两种。 [0010]一些实施方案中， 所述链球菌毒力因子包括virulence  factor database  (VFDB) 数据库中所有可检出的毒力因子， 具体包括：说　明　书 1/5 页 3 CN 114807342 A 3