(19)国家知识产权局 (12)发明 专利 (10)授权公告 号 (45)授权公告日 (21)申请 号 20221049020 0.4 (22)申请日 2022.05.07 (65)同一申请的已公布的文献号 申请公布号 CN 114592097 A (43)申请公布日 2022.06.07 (73)专利权人 北京生物制品研究所有限责任公 司 地址 100176 北京市大兴区北京经济技 术 开发区博兴二路9号院4 号楼2层205室 (72)发明人 杨晓明　王辉　赵玉秀　梁宏阳　 王展慧　郭彦岑　何振玉　贺瑶　 (74)专利代理 机构 北京三友知识产权代理有限 公司 11127 专利代理师 韩蕾　张德斌(51)Int.Cl. C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (56)对比文件 CN 114085928 A,202 2.02.25 CN 113943838 A,202 2.01.18 CN 114410848 A,202 2.04.29 CN 114107574 A,202 2.03.01 CN 114369688 A,2022.04.19 CDC.Science Brief: O micron (B.1.1.52 9) Variant. 《CDC》 .2021,1- 6. 审查员 吕小蒙 (54)发明名称 鉴别新型冠状病毒Omicron株BA.1和/或 BA.3亚系的引物、 探 针及其应用 (57)摘要 本发明提供了一种鉴别新型冠状病毒 Omicron株BA.1和/或B A.3亚系的引物、 探针及其 应用。 本发明的引物包括如SEQ  ID NO.1所示序 列的引物和如SEQ  ID NO.2所示序列的引物。 本 发明的探针包括如SEQ  ID NO.5所示序列的探 针。 本发明的探针进一步包括如SEQ  ID NO.6所 示序列的探针。 利用本发明的引物和探针， 可通 过PCR方法将新型冠状病毒Omicron株B A.1和/或 BA.3亚系与其它毒株鉴别区分开。 权利要求书2页 说明书10页 序列表4页 附图6页 CN 114592097 B 2022.07.29 CN 114592097 B 1.一种用于双重探针qPCR方法鉴别新型冠状病毒Omicron株BA.1和/或BA.3亚系的引 物和探针的组合物， 其特征在于， 该组合物包括两组分别用于双重探针qPCR方法的引物和 探针的组合物， 其中一组包括如SEQ  ID NO.1所示序列的引物和如SEQ  ID NO.2所示序列的 引物以及如SEQ  ID NO.5所示序列的探针和如SEQ  ID NO.7所示序列的探针， 用于鉴别样品 中是否存在新型冠状病毒Omicron株BA.1和/或BA.3亚系； 另一组包括如SEQ  ID NO.3所示 序列的引物和如SEQ  ID NO.4所示序列的引物以及如SEQ  ID NO.6所示序列的探针和如SEQ   ID NO.8所示序列的探针， 用于将新型冠状病毒Omicron株BA.1和/或BA.3亚系阳性样品中 的新型冠状病毒O micron株BA.1与BA.3亚系鉴别区分开： SEQ ID NO.1： 5’ ‑GTCTGTGA ATTTCAATTTTGTAATG‑3’； SEQ ID NO.2： 5’ ‑CTCTGAACTCACTTTCCATCC‑3’； SEQ ID NO.3： 5’ ‑TAAAATATATTCTAAGCACACGC C‑3’； SEQ ID NO.4： 5’ ‑CTACCAATGGTTCTAAAGCC‑3’； SEQ ID NO.5： 5’ ‑CCATTTTTGGACCACAAAAAC‑3’； SEQ ID NO.6： 5’ ‑GCGTGAGC CAGAAGATCTCC‑3’； SEQ ID NO.7： 5’ ‑CATTTTTGGGTGTTTATTACCACAAAAAC‑3’； SEQ ID NO.8： 5’ ‑GTGCGTGATCTC CCTCAG‑3’。 2.根据权利要求1所述的用于双重探针qPCR方法鉴别新型冠状病毒Omicron株BA.1和/ 或BA.3亚系的引物和探针的组合物， 其特征在于， 所述探针是经荧光基团修饰的， 所述修饰 包括： 探针序列5 ’端碱基采用荧光报告基团修饰， 同时探针序列3 ’端碱基采用荧光淬灭基团 修饰。 3.一种用于双重探针qPCR方法鉴别新型冠状病毒Omicron株BA.1和/或BA.3亚系的试 剂盒， 其特 征在于， 所述试剂盒包 含： 权利要求1或2所述的引物和探针的组合物； 所述试剂盒还 包括阳性质控品和阴性质控品。 4.一种非诊断目的的权利要求1或2所述的引物和探针的组合物或权利要求3所述的试 剂盒在体外双重探针qPCR方法鉴别样品中是否存在新型冠状病毒Omicron株BA.1和/或 BA.3亚系的应用， 其中， 如SEQ  ID NO.1所示序列的引物和如SEQ  ID NO.2所示序列的引物 以及如SEQ  ID NO.5所示序列的探针和如SEQ  ID NO.7所示序列的探针用于鉴别样品中是 否存在新型冠状病毒Omicron株BA.1和/或BA.3亚系； 如SEQ  ID NO.3所示序列的引物和如 SEQ ID NO.4所示序列的引物以及如SEQ  ID NO.6所示序列的探针和如SEQ  ID NO.8所示序 列的探针用于将新型冠状病毒Omicron株BA.1和/或BA.3亚系阳性样品中的新型冠状病毒 Omicron株BA.1与BA.3亚系鉴别区分开。 5.根据权利要求4所述的应用， 其特征在于， 通过PCR反应鉴别样品中是否存在新型冠 状病毒Omicron株BA.1和/或BA.3亚系， 所述引物在PCR反应体系中的终浓度为0.1 ‑10 μM， 所 述探针在PCR反应 体系中的终浓度为0.1 ‑10 μM。 6.根据权利要求 4或5所述的应用， 其特 征在于， 其中如SEQ  ID NO.5所示序列的探针的扩增曲线为S型曲线， 鉴定为新型冠状病毒 Omicron株BA.1或BA.3亚系阳性； 其中如SEQ  ID NO.6所示序列的探针的扩增曲线为S型曲 线， 鉴定为 新型冠状病毒O micron株BA.1亚系阳性； 或者，权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114592097 B 2其中如SEQ  ID NO.5所示序列的探针的扩增曲线为S型曲线， 且如SEQ  ID NO.6所示序 列的探针的扩增曲线为非S型曲线， 鉴定为 新型冠状病毒O micron株BA.3亚系阳性。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114592097 B 3