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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210518171.8 (22)申请日 2022.05.12 (71)申请人 西安博睿康宁生物医学中心有限公 司 地址 712000 陕西省咸阳市渭城区周陵街 办长信科技产业园17幢 (72)发明人 李睿 高博 刘贵明 (74)专利代理 机构 北京路浩知识产权代理有限 公司 11002 专利代理师 孙怡 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6851(2018.01) (54)发明名称 用于检测人类BRAF基因V600E突变的引物探 针组合、 试剂盒和方法 (57)摘要 本发明涉及肿瘤靶向用药基因检测突变检 测技术领域, 具体公开了用于检测人类BRAF基因 V600E突变的引物探针组合、 试剂盒和方法。 本发 明用于检测人类BRAF基因V 600E突变的引物 探针 组合, 其包含两条上游引物、 一条下游引物、 一条 荧光探针和两条阻碍探针; 两条所述上游引物如 SEQ ID NO.1‑2所示, 所述下游引物如SEQ ID NO.3所示, 所述荧光探针如SEQ ID NO.4所示, 两 条所述阻碍探针如SEQ ID NO.5‑6所示。 本发明 利用双引物探针以及阻碍探针来降低正常基因 对检测的干扰, 提高了检测灵敏度, 且检测速度 快速准确。 可进行突变率达 0.1%的DNA检测。 权利要求书2页 说明书7页 序列表2页 附图4页 CN 114774550 A 2022.07.22 CN 114774550 A 1.用于检测人类BRAF基因V600E突变的引物探针组合, 其特征在于, 包含两条上游引 物、 一条下游引物、 一条荧光探针和两条阻碍探针; 两条所述上游引物如SEQ ID NO.1‑2所 示, 所述下游引物如SEQ ID NO.3所示, 所述荧光探针如SEQ ID NO.4所示, 两条所述阻碍探 针如SEQ ID NO.5‑6所示。 2.根据权利 要求1所述的引物探针组合, 其特征在于, 如SEQ ID NO.1所示的上游引物、 所述下游引物、 所述荧光探针和如SEQ ID NO.5所示的阻碍探针在反应体系1中使用, 所述 反应体系1用于检测突变序列; 如SEQ ID NO.2所示的上游引物、 所述下游引物、 所述荧光探针和如SEQ ID NO.6所示 的阻碍探针在反应 体系2中使用, 所述反应 体系2用于检测野生序列。 3.根据权利要求1或2所述的引物探针组合, 所述荧光探针的两端分别标记有荧光报告 基团和荧 光猝灭基团; 和/或, 两条 所述阻碍 探针的3’端用‑NH2修饰。 4.根据权利要求1~3任一项所述的引物探针组合, 其特征在于, 所述荧光报告基团为 选自FAM, VIC, C Y5中的任一种; 所述 荧光猝灭基团为选自BHQ1, NH2, MGB中的任一种。 5.权利要求1~4任一项所述的引物探针组合在制备用于检测人类BRAF基因V600E突变 的试剂盒中的应用。 6.用于检测人类BRAF基因V600E突变的试剂盒, 其特征在于, 包含权利 要求1~4任一项 所述的引物探针组合。 7.根据权利要求6所述的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂盒在进行荧光定量PCR反应时 的条件为: 94℃2mi n; 95℃30s, 65℃30s, 运行40个 循环, 在6 5℃时收集信号。 8.根据权利要求6或7所述的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂盒在进行荧光定量PCR反应 时每20 μL无模板反应体系为: 缓冲液 12.5 μL, 10 μM上游引物0.2 μL, 10 μM 下游引物0.2 μL, 10 μ M荧光探针0.1 μL, 10 μM阻碍 探针0.1 μL, 水6.9 μL。 9.一种非疾病诊断目的检测人类BRAF基因V600E突变的方法, 其特征在于, 以待测 样品 的DNA为检测模板, 进行两次荧光定量PCR反应, 第一次荧光定量PCR反应利用如SEQ ID NO.1所示的上游引物、 如SEQ ID NO.3所示的下游引物、 如SEQ ID NO.4所示的荧光探针和 如SEQ ID NO.5所示的阻碍 探针进行, 获得反应 体系1的FAM信号 值; 第二次荧光定量PCR反应利用如SEQ ID NO.2所示的上游引物、 如SEQ ID NO.3所示的 下游引物、 如SEQ ID NO.4所示的荧光探针和如SEQ ID NO.6所示的阻碍探针进行, 获得反 应体系2的FAM信号 值; 当反应体系2的FAM信号值高于反应体系1的FAM信号值, 且两个FAM信号Ct差值ΔCt大 于8时, 则判断检测结果 为阴性, Δ Ct小于等于8时, 则判断检测结果 为V600E突变阳性; 当反应体系2的FAM信号值等于反应体系1的FAM信号值, 且两个FAM信号Ct差值ΔCt小 于等于1时, 则判断检测结果 为V600E突变阳性; 当反应体系2的FAM信号值低于反应体系1的FAM信号值, 且两个FAM信号Ct差值ΔCt大 于1时, 则判断检测结果有误, 需重新取样检测。 10.根据权利要求9所述的方法, 其特征在于, 所述荧光定量PCR反应的条件为: 94℃ 2min; 95℃30s, 65℃30s, 运行40个 循环, 在6 5℃时收集信号; 所述荧光定量PCR反应的每20 μL无模板反应体系为: 缓冲液12.5 μL, 10 μM上游引物0.2 μ权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114774550 A 2L, 10 μM下游引物0.2 μL, 10 μM荧 光探针0.1 μL, 10 μM阻碍 探针0.1 μL, 水6.9 μL。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114774550 A 3
专利 用于检测人类BRAF基因V600E突变的引物探针组合、试剂盒和方法
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