(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210510256.1 (22)申请日 2022.05.11 (71)申请人 上海市农业 生物基因中心 地址 201106 上海市闵行区北翟路2 901号 (72)发明人 刘毅　孔德艳　张安宁　王飞名　 张分云　刘国兰　罗星星　余新桥　 罗利军　 (74)专利代理 机构 北京方圆嘉 禾知识产权代理 有限公司 1 1385 专利代理师 朱玲艳 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种水稻柱头外露率主效QTL-qTSE8、 检测 引物、 试剂盒和应用 (57)摘要 本发明涉及一种水稻柱头外露率主效QTL ‑ qTSE8、 检测引物、 试剂盒和应用， 属于分子生物 学技术领域。 本发明提供了一种水稻柱头外露率 主效QTL‑qTSE8， 所述主效QT L‑qTSE8被定位在第 8染色体上， 位于连锁标记RM38和RM2 5之间。 利用 连锁标记构建含有本发明主效QT L‑qTSE8的近等 基因系柱头外露率显著提高， 为 分子标记辅助选 择改良水稻柱头外露率， 提高不育系异交结实率 和制种产量 提供了参 考。 权利要求书1页 说明书9页 序列表1页 附图4页 CN 114686616 A 2022.07.01 CN 114686616 A 1.一种水稻柱头外露率主效QTL ‑qTSE8， 其特征在于， 所述主效QTL ‑qTSE8被定位在第8 染色体上， 位于连锁标记RM 38和RM25之间。 2.一组检测水稻柱头外露率主效QTL ‑qTSE8的引物， 其特征在于， 所述引物包括RM38的 引物和RM25的引物； 所述RM38的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所示； 所 述RM25的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.3和SEQ  ID NO.4所示。 3.一种检测水稻柱头外露率主效QTL ‑qTSE8的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒包括权 利要求2所述引物和反应液。 4.检测权利 要求1或2所述QTL ‑qTSE8的物质在培育或检测高柱头外露率的水稻品种中 的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114686616 A 2一种水稻柱头外露率主 效QTL‑qTSE8、 检测引物、 试剂盒和 应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子生物学技术领域， 具体涉及一种水稻柱头外露率主效QTL ‑qTSE8、 检测引物、 试剂盒和应用。 背景技术 [0002]水稻作为最重要的粮食作物之一， 养活了全球一半以上的人口， 水稻产量的丰欠 将直接影响到粮食安全和社会稳定， 提高单位面积的粮食产量一直是育种者最重要的目 标。 杂交水稻的商业化推广极大地促进了粮食产量的增加， 其种子生产能力的提高发挥了 重要的作用。 不育系的异交性能是影响杂交水稻制种产量的关键因素， 而柱头外露率则是 提高不育系异交性能最 为重要的性状。 [0003]随着基因组学和 分子标记的发展， 不 同的研究者基于连锁分析， 利用野生稻和 栽 培稻或者籼粳杂交构建的作图群体， 或者基于关联分析， 利用核心种质的自然群体进行了 相关的QTL定位研究， 定位到超过40个控制柱头外露率的QTL位点在水稻12条染色体上均有 分布， 定位结果不尽相同， 且只有少量QTL解释超过10％的表型变异， 表明柱头外露率是受 微效多基因控制的数量性状。 利用分子标记辅助选择改良水稻 柱头外露率性状是一个有效 的手段。 挖掘稳定的、 可靠的控制柱头外露率的QTL， 对提高柱头外露率的改良效率起到重 要作用， 有利于杂交制种产量 提高和成本降低， 促进杂交水稻的商业 化推广应用。 发明内容 [0004]本发明的目的在 于提供一种水稻柱头外露率主效QTL ‑qTSE8、 检测引物、 试剂盒和 应用。 利用连锁标记构建含有本发 明主效QTL ‑qTSE8的近等基因系柱头外露率显著提高， 为 分子标记辅助选择改良水稻柱头 外露率， 提高不育系异交结实率和制种产量 提供了参 考。 [0005]本发明提供了一种水稻 柱头外露率主效QTL ‑qTSE8， 所述主效QTL ‑qTSE8被定位在 第8染色体上， 位于连锁标记RM 38和RM25之间。 [0006]本发明还提供了一组检测水稻柱头外露率主效QTL ‑qTSE8的引物， 所述引物包括 RM38的引物和RM2 5的引物； 所述RM38的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所 示； 所述RM25的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.3和SEQ  ID NO.4所示。 [0007]本发明还提供了一种检测水稻柱头外露率主效QTL ‑qTSE8的试剂盒， 所述试剂盒 包括上述 技术方案所述引物和反应液。 [0008]本发明还提供了检测上述技术方案所述QTL ‑qTSE8的物质在 培育或检测高柱头外 露率的水稻品种中的应用。 [0009]本发明提供了一种水稻柱头外露率主效QTL ‑qTSE8。 本发明利用重组自交系的连 锁分析和自然群体的关联分析， 在第8染色体上重复鉴定到一个稳定影响柱头外露率的主 效QTL位点， 为进一步精细定位和候选基因克隆提供了可靠依据， 利用连锁标记构建含有 该 主效QTL位点的近等基因系柱头外露率显著提高， 为分子标记辅助选择改良水稻柱头外露说　明　书 1/9 页 3 CN 114686616 A 3