(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210512581.1 (22)申请日 2022.05.11 (71)申请人 北京先声医学检验实验室有限公司 地址 102206 北京市昌平区生命科 学园医 科路9号院2号楼6层 申请人 南京先声医学检验实验室有限公司 　 江苏先声医学诊断有限公司 (72)发明人 朱金瑶　胥慧　郭涛　张丽杰　 李诗濛　任用　 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 用于泛癌种化疗用药指导的检测组合物、 试 剂盒及其应用 (57)摘要 本申请涉及基因检测技术领域， 具体提供了 一种用于泛癌种化疗用药指导检测的组合物及 试剂盒， 本申请基于飞行时间质谱平台， 实现对 泛癌种化疗用药相关的34个SNP位点进行检测。 具有准确性高、 特异性强、 灵敏性高和通量大等 优点， 同时还具有节省样本、 检测周期短、 操作简 易和分析方便等优势， 能够对于癌症患者进行个 体化治疗提供指导 意义。 权利要求书1页 说明书17页 附图15页 CN 115232873 A 2022.10.25 CN 115232873 A 1.一种基于飞行时间质谱平台的、 用于泛癌种化疗用药指导检测的引物组， 其特征在 于， 所述引物组针对如下位点： rs4880、 rs1801133、 rs716274、 rs1800566、 rs1801019、 rs2234693、 rs11280056、 rs2228001、 rs4244285、 rs442767、 rs67376798、 rs1801265、 rs1801159、 rs55886062、 rs3918290、 rs1695、 rs11545078、 rs4646、 rs3892097、 rs10509373、 rs1056892、 rs11572080、 rs25487、 rs1045642、 rs2072671、 rs1042522、 rs11615、 rs3212986、 rs11045879、 rs1 142345、 rs7984870、 rs1 1598702、 rs3 064744和rs4148323 。 2.根据权利要求1所述的引物组， 其特征在于， 所述引物组包括68条扩增引物， 所述引 物序列如SEQ  ID NO.1‑68所示。 3.根据权利 要求2所述的引物组， 其特征在于， 所述引物组还包括34条UEP延伸引物， 所 述引物序列如SEQ  ID NO.69‑102所示。 4.根据权利要求2 ‑3任一所述的引物 组， 其特征在于， 所述引物分两组， 组1引物序列如 SEQ ID NO.1‑36所示， UEP延伸引物序列如SEQ  ID NO.69‑86所示； 组2扩增引物序列如SEQ   ID NO.37‑68所示， UEP 延伸引物序列如SEQ  ID NO.87‑102所示。 5.一种用于泛癌种化疗用药指导检测的组合物， 其特征在于， 所述组合物包含权利要 求1‑4任一所述的引物组。 6.一种用于泛癌种化疗用药指导检测的产品， 其特征在于， 所述产品包含权利要求1 ‑4 任一所述的引物组。 7.一种用于泛癌种化疗用药指导检测的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒包含权利要 求1‑4任一所述的引物组。 8.根据权利要求7所述的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒还包括用于MassARRAY核酸 质谱检测的常规试剂组分。 9.权利要求1 ‑4任一项所述的引物组在制备泛癌种化疗用药指导的检测产品中的应 用。 10.一种泛癌种化疗用药指导的检测方法， 其特征在于， 所述方法包括利用权利要求1 ‑ 4任一引物组的步骤。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115232873 A 2用于泛癌种化疗用药指导 的检测组合物、 试剂盒及其应用 技术领域 [0001]本申请涉及基 因检测技术领域， 尤其是涉及一种用于泛癌种化疗用药指导的检测 组合物、 试剂盒及其应用。 背景技术 [0002]恶性肿瘤主要治疗方法有外科手术， 放疗， 化疗和分子靶向药物治疗， 外科手术是 指用外科手术的方法， 去除癌变组织、 修复损伤、 移植器官等， 放疗是指用特殊的放射线间 接或直接损伤细胞DNA， 化疗是指利用化学药物抑制肿瘤细胞生长繁殖、 杀死肿瘤细胞或促 进肿瘤细胞分化的一种治疗方法。 目前， 在几种方法之间， 化疗在肿瘤临床治疗中约占 70％， 特别对于失去外科手术治疗意义的晚期癌症病人， 化疗更是主要甚至唯一的治疗手 段。 虽然近年来在肿瘤生物学研究和治疗领域有较大进展， 但目前临床上用于化疗的药物 仍有很大 的局限性。 大多数传统化疗药物在抑制肿瘤细胞 的同时， 对正常细胞有较大 的毒 性， 副作用严重， 原因在于药物进入 人体后， 通常要 经过吸收、 转运、 代谢、 受体结合(或与靶 酶结合)等过程才能发挥药理作用， 如果基因突变则可能造成药物代谢过程中相关代谢酶、 受体、 转运体等功能的差异， 这些差异的累积最 终使药物效应(治疗作用/不良反应)呈现多 样性， 即个体差异， 从而导致不同患者使用同样一种化疗药物， 效果会不同， 副作用也不同。 因此， 明确个体的药物基因类型可以帮助临床医生有针对性的制 定治疗策略， 给予患者最 优的治疗方案， 减少许多 无意义治疗时间， 减少治疗费用， 提高生成质量， 延 长生存周期， 从 而实现精准用药。 [0003]化疗中常用的药物有抗肿瘤和抗代谢两种， 主要包括柏类、 5 ‑FU/卡培他滨、 紫杉 类、 蒽环类、 甲氨蝶呤、 培美曲塞、 来曲唑/阿那曲唑、 长春碱类、 吉西他滨、 环磷酰胺/异环磷 酰胺、 伊立替康、 依 托泊苷、 他莫昔芬、 硫唑嘌 呤/巯基嘌 呤/硫鸟嘌 呤等。 而与这些药物药敏 性相关的基因有多种， 每种基因会参与一种或多种化疗药物的代谢过程， 譬如研究表明在 接受铂类和紫杉类药物化疗的卵巢癌患者中， GSTP1(rs1695)基因型为AA时与GG/AG基因型 相比， 血液毒性风险较高； 在接受表柔比星和环磷酰胺化疗的乳腺癌患者中， GSTP1 (rs1695)基因型为AA时与GG基因型相比， 药物应答率较高， 药物毒性风险降低。 在接受铂类 药物化疗的晚期非小细胞肺癌患者中， MTHFR(rs1801133)基因型为AA时与GG/AG基因型相 比， 药物应答率较高； 在接受甲氨蝶呤化疗的伯基特淋巴瘤和T细胞前体细胞急性淋巴性白 血病患者中，  MTHFR(rs1801133)基因型为AA时与GG/AG基因型相比， 药物毒 性风险较高。 所 以， 在使用化疗 药物前对患者上述基因位点的SNP特征进 行检测， 然后根据不同药物基因型 采取不同的个体化化疗方案： 对于具有上述敏感位点的个体可采用常规剂量化疗； 而对于 其他组合类型， 若疗效不明显， 则可通过加大化疗 药物剂量或选择其他化疗药物进 行治疗， 从而达到有效治疗的目的。 [0004]目前， 国内所采用的泛癌种化疗用药指导基因SNP位点检测技术主要有： DNA测序 法， 包括直接测序法和焦磷酸测序法， 前者通量低、 且样本消耗大， 平均每个位点检测需消 耗100ng， 后者对于多个单碱基重复序列的准确性偏低； 限制性 酶切片段长度多态 性(RFLP)说　明　书 1/17 页 3 CN 115232873 A 3