(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210511057.2 (22)申请日 2022.05.11 (71)申请人 上海市农业 生物基因中心 地址 201106 上海市闵行区北翟路2 901号 (72)发明人 刘毅　张安宁　王飞名　罗星星　 孔德艳　张分云　毕俊国　刘国兰　 余新桥　罗利军　 (74)专利代理 机构 北京方圆嘉 禾知识产权代理 有限公司 1 1385 专利代理师 朱玲艳 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6869(2018.01) (54)发明名称 一种水稻柱头外露率主效QTL、 检测引物、 试 剂盒和应用 (57)摘要 本发明涉及一种水稻柱头外露率主效QTL、 检测引物、 试剂盒和应用， 属于分子生物学技术 领域。 本发明提供了一种水稻柱头外露率主效 QTL， 所述主效QT L被定位在第9染色体 上， 位于连 锁标记RM23662和RM3700之间。 本发明所述主效 QTL能够控制水稻柱头外露率， 将所述主效QT L导 入水稻优良不育系中， 能够提高水稻不育系的柱 头外露率， 提高制繁种产量， 加快育种进程。 权利要求书1页 说明书6页 序列表1页 附图2页 CN 114807420 A 2022.07.29 CN 114807420 A 1.一种水稻柱头外露率主效QTL， 其特征在于， 所述主效QTL被定位在第9染色体上， 位 于连锁标记RM23 662和RM3700之间。 2.一组检测水稻柱头外露率主效QTL的引物， 其特征在于， 所述引物包括RM23662的引 物和RM3700的引物； 所述RM2 3662的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所示； 所述RM3700的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.3和SEQ  ID NO.4所示。 3.一种检测水稻柱头外露率主效QTL的试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂盒包括权利要求 2所述引物和反应液。 4.检测权利要求1或2所述主效QTL的物质在培育或检测高柱头外露率的水稻品种中的 应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114807420 A 2一种水稻柱头外露率主 效QTL、 检测引物、 试剂盒和应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子生物学技术领域， 具体涉及一种水稻柱头外露率主效QTL、 检测引 物、 试剂盒和应用。 背景技术 [0002]水稻作为最重要的粮食作物之一， 养活了全球一半以上的人口， 水稻产量的丰欠 将直接影响到粮食安全和社会稳定， 提高单位面积的粮食产量一直是育种者最重要的目 标。 杂交水稻的商业化推广极大地促进了粮食产量的增加， 其种子生产能力的提高发挥了 重要的作用。 不育系的异交性能是影响杂交水稻制种产量的关键因素， 而柱头外露率则是 提高不育系异交性能最 为重要的性状。 [0003]水稻柱头外露率是多基因控制的数量性状， 各世代均呈连续性变异。 针对柱头外 露率性状， 研究人员利用不同的分离群体， 基于连锁分析， 进行了大量的QTL定位工作。 此 外， 还有学者利用BSA法和关联分析对柱头外露率进行QTL定位。 随着水稻基因组测序的完 成以及二代测序技术的日趋成熟， QTL ‑seq法应运而生， 相较于传统的图位克隆方法构建群 体耗时， 缺少足够的分子标记， QTL ‑seq法基于第二代测序产生的高密度遗传图谱， NGS结合 BSA更快捷、 效率更高、 成本更低。 研究报道定位的QTLs数目很多， 分布在水稻的12条染色体 上， 但是单个QTL解释的表型变异多在10％以内， 表明柱头外露率是一个受多个微效QTL影 响的典型的数量性状。 利用分子标记辅助选择改良水稻柱头外露率性状是一个有效的手 段。 所以， 挖掘稳定的、 可靠的控制柱头外露率的QTL， 对提高柱头外露率的改良效率起到重 要作用， 有利于杂交制种产量 提高和成本降低， 促进杂交水稻的商业 化推广应用。 发明内容 [0004]本发明的目的在于提供一种水稻柱头外露率主效QTL、 检测引物、 试剂盒和应用。 本发明所述主效QTL能够控制水稻柱头外露率， 将所述主效QTL导入水稻优良不育系中， 能 够提高水稻不育系的柱头 外露率， 提高制繁种产量， 加快育种进程。 [0005]本发明提供了一种水稻柱头外露率主效QTL， 所述主效QTL被定位在第9染色体上， 位于连锁标记RM23 662和RM3700之间。 [0006]本发明还提供了一组检测水稻柱头外露率主效QTL的引物， 所述引物包括RM23662 的引物和RM3700的引物； 所述RM23662的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2 所示； 所述RM 3700的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.3和SEQ  ID NO.4所示。 [0007]本发明还提供了一种检测水稻柱头外露率主效QTL的试剂盒， 所述试剂盒包括上 述技术方案所述引物和反应液。 [0008]本发明还提供了检测上述技术方案所述主效QTL的物质在培育或检测高柱头外露 率的水稻品种中的应用。 [0009]本发明提供了一种水稻柱头外露率主效QTL。 本发明利用沪旱1B和P3155B(沪旱 1B/K17B//沪旱1B///沪旱1B)构建的F2群体， 采用QTL ‑seq和SSR标记两种分析方法， 在第9说　明　书 1/6 页 3 CN 114807420 A 3