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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210484759.6 (22)申请日 2022.05.06 (71)申请人 首都医科 大学附属北京朝阳医院 地址 100020 北京市朝阳区工 体南路8号首 都医科大学附属北京朝阳医院 (72)发明人 李锋 张莹 郭丹丹 文豪 贾兴元 黄骁舾 宋凌勰 曹嘉晨 (74)专利代理 机构 北京八月瓜知识产权代理有 限公司 1 1543 专利代理师 袁晓雨 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/6851(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 软组织血管纤维瘤分子标志物及其检测试 剂盒 (57)摘要 本发明涉及生物医学检验技术领域, 尤其是 涉及软组织血管纤维瘤分子标志物及其检测试 剂盒, 所述 分子标志物为PTCH1 ‑PLAG1融合基因, 其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。 本发明的融 合基因PTCH1 ‑PLAG1, 是由位于染色体9q22上的 PTCH1基因Exon 1末端与位于染色体8q12上的 PLAG1基因Exon 3前端融合形成 , 属于 translocation类 型中的splice ‑site融合位点。 本发明基于一步法qRT ‑PCR技术检测石 蜡包埋组 织中PTCH1 ‑PLAG1融合基因的试剂盒, 可实现对 石蜡组织中PTCH1 ‑PLAG1 mRNA的绝对定量检测, 可操作性及重复性强, 灵敏度和特异性较高。 权利要求书1页 说明书10页 序列表1页 附图5页 CN 114574590 A 2022.06.03 CN 114574590 A 1.一种软组织血管纤维瘤分子标志物, 其特征在于, 所述分子标志物为PTCH1 ‑PLAG1融 合基因, 所述PTC H1‑PLAG1融合基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。 2.根据权利要求1所述的软组织血管纤维瘤分子标志物, 其特征在于, 所述PTCH1 ‑ PLAG1融合基因由位于染色体9q22上的PTCH1基因Exon 1末端与位于染色体8q12上的PLAG1 基因Exon 3前端融合而成。 3.根据权利要求1所述的软组织血管纤维瘤分子标志物, 其特征在于, PTCH1 ‑PLAG1融 合基因的融合 位点为PTCH1‑chr9和PLAG1 ‑chr8。 4.一种检测人软组织血管纤维瘤的检测试剂 盒, 其特征在于, 包括权利要求1 ‑3任一项 所述PTCH1‑PLAG1融合基因的试剂。 5.根据权利要求4所述的检测人软组织血管纤维瘤的检测试剂 盒, 其特征在于, 还包括 权利要求1所述PTC H1‑PLAG1融合基因的引物组合物。 6.根据权利要求5所述的检测人软组织血管纤维瘤的检测试剂 盒, 其特征在于, 所述引 物组合物包括正向引物和反向引物, 所述正向引物的序列如SEQ ID No.2所示, 所述反向引 物的序列如SEQ ID No.3所示。 7.根据权利要求4所述的检测人软组织血管纤维瘤的检测试剂 盒, 其特征在于, 还包括 权利要求1所述PTC H1‑PLAG1融合基因的探针, 所述探针的序列如SEQ ID No.4所示。 8.根据权利要求4所述的检测人软组织血管纤维瘤的检测试剂 盒, 其特征在于, 还包括 阳性定量参考品, 所述阳性定量参考品为含有PTCH1 ‑PLAG1融合基因接合位点片段的PESI ‑ T质粒。 9.根据权利要求4所述的检测人软组织血管纤维瘤的检测试剂 盒, 其特征在于, 还包括 阴性对照, 所述阴性对照为融合基因PTCH1 ‑PLAG1呈阴性的人上皮样血管内皮瘤石蜡包埋 组织。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114574590 A 2软组织血 管纤维瘤分子标志物及其检测试剂盒 技术领域 [0001]本发明涉及 生物医学检验技术领域, 尤其是涉及软组织血管纤维瘤分子标志物及 其检测试剂盒。 背景技术 [0002]软组织血管纤维瘤 (Angiofibroma of Soft Tissue, AFST) 是2012年由Mari ño‑ Enríquez 和Fletcher首先报道并命名的一种具有独特 临床病理和分子遗传学特征的良性 纤维血管性肿瘤, 并被作为一个新病种收录入2020版WH O骨和软组织肿瘤分类中。 迄今国内 外有关AFST的文 献报道约100例, 对其临床病理和分子遗传学特征尚缺少足够的认识。 组织 学上, AFST富含血管, 基质经常黏液样变性, 易误诊为其他富含血管和/或黏液样基质的软 组织肿瘤, 特别是血管性肿瘤和黏液样软组织肿瘤, 后者如低级别黏液纤维肉瘤和 黏液样 脂肪肉瘤等。 AFST没有特异的免疫组化标记, 肿瘤细胞常表达Vimentin、 ER和CD163, 也不同 程度的表达 EMA、 CD68、 D2 ‑40、 Desmin、 PR、 α‑SMA、 CD34和STAT6等。 [0003]2012年Jin等证实AFST中存在t(5;8)(p15;q13)染色体易位及其融合基因AHRR ‑ NCOA2/NCOA2 ‑AHRR等。 目前, 文献已报道的AFST中存在的染色体易位及其融合基因见表1。 其中最常见的是t(5;8)(p15;q13)及其融合基因AHRR ‑NCOA2 / NCOA2‑AHRR, 少数为t (7; 8;14) (q11;q13;q31) 及其融合基因GTF2I ‑NCOA2 、 t (4;5) (q24;q31)及其融合基因 NCOA2‑ETV4、 ETV4 ‑AHRR、 P4HA2 ‑TBCK等。 运用RT ‑PCR、 FISH或二代测序等手段对这些 染色体 易位或融合基因进行检测, 有助于AFST的诊断、 分型和鉴别诊断。 [0004]表1文献报道软组织血 管纤维瘤存在的染色体易 位及其融合基因 近期, 申请者运用转录组测序、 RT ‑PCR和FISH技术, 在1例人软组织血管纤维瘤石 蜡包埋组织中发现和 验证了一个新的融合基因PTCH1 ‑PLAG1, 它是由位于染色体9q22上的 PTCH1基因Exon 1末端与位于8q12上的PLAG1基因Exon 3前端融合形成, 属于 transloc ation类型中的splice ‑site融合位点。 而目前国内外尚未见PTCH1 ‑PLAG1融合基 因在软组织血 管纤维瘤或其它肿瘤的研究报道。说 明 书 1/10 页 3 CN 114574590 A 3
专利 软组织血管纤维瘤分子标志物及其检测试剂盒
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